庚 陈

高级总监

About

1、从2007年开始踏入生物信息学领域,涉及各类生物信息软件开发、人工智能算法开发、不同数据库构建、各类高通量测序大数据分析等,至今已有15年的相关研究和工作经验。具有丰富的生物信息学科研界和工业界经验。已在 Nature Biotechnology、Nature Communications、Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics、 Genome Research等国际高水平SCI期刊发表论文近60篇。 2、精通各类组学整合设计与分析,包括群体细胞和单细胞测序等各种组学大数据分析和项目设计,如基因组、表观组、转录组、蛋白质组、代谢组、宏基因组等; 3、受瑞士国际SCI期刊Frontiers杂志社邀请作为Frontier s in Immunology(IF=8.8)、Frontiers in Cell and Developmental Biology、Frontiers in Oncology、Frontiers in Genetics等杂志的leading客座主编,连同国内外知名的教授一起发起单细胞测序和群体细胞测序相关的研究专刊多个。 4、特邀为Advanced Science (IF=17.52); Nucleic Acids Research (IF=19.16)、 Nature Communications (IF=17.69)、Genome Biology (IF=17.9)、 Briefings in Bioinformatics (IF=14)、 Clinical and Translatioal and Medicine (IF=11.49)等国际高水平一流SCI期刊审稿人。 5、受邀作为国家自然科学基金面上项目,青年项目,地区项目等项目的评审人,并且在华东师范大学工作期间作为负责人获得国家自然科学基金面上项目2项、负责国家重点研发项目子项目、国家自然科学基金重点培育项目子项目等。 6、擅长领域: 1)带领团队开发各类AI生物信息学算法和软件; 2)带领团队开发和构建各类生物信息学相关数据库等 3)带领团队整合分析基于高通量测序技术产生群体细胞或单细胞各类多组学大数据整合分析的大项目,系统地解析和挖掘疾病特别是癌症/肿瘤的生物标志物、药物靶点、致病机理等; 4)带领团队设计和开发各类多组学生物和医学大数据AI分析方法和平台等; 5)设计和管理基于单细胞测序技术和相应的生物信息学分析的大项目,在单细胞水平系统解析细胞异质性、细胞间通信网络、基因调控网络等,阐释相应的潜在机制;

Country

China

City

Shanghai

Industry

Pharmaceuticals

Skill

生物信息学, 多组学数据分析, 高通量测序数据分析, 单细胞测序数据分析, 基因组测序数据分析, 转录组测序数据分析, 甲基化数据分析, 软件开发, 数据库开发

Experience

斯微(上海)生物科技股份有限公司

高级总监

斯微(上海)生物科技股份有限公司

2022-1 - Present · 4 yrs 9 mos

中国 上海市 浦东新区

无锡臻和生物科技股份有限公司

科研生信总监

无锡臻和生物科技股份有限公司

2021-1 - 2022-1 · 1 yr 1 mo

中国 上海市

1、带领团队开发液体活检相关的算法; 2、作为负责人开发《从课题设计到文章发表》的一系列课程,并给公司各团队成员逐期分享; 3、受邀作为瑞士国际SCI期刊Frontiers in Cell and Developmental Biology,还有Frontiers in Genetics等期刊的客座主编,发起相关的多组学测序大数据分析专刊等

INOMIXO

生物信息学部门负责人

INOMIXO

LinkedIn
2020-9 - 2021-1 · 5 mos

1、作为负责人设计各类单组学的高级数据分析及多组学整合的高级分析; 2、带领团队成功开发多组学大数据的整合分析自动化流程; 3、为公司在线宣讲,及参与客户的合作洽谈等

East China Normal University

副研究员-(硕士生导师)生物信息学

East China Normal University

LinkedIn
2016-11 - 2020-9 · 3 yrs 11 mos

1、作为项目负责人获得国家自然科学基金面上项目2项,获得国家重点研发计划项目子项目1项,获得国家重点培育项目子项目1项等多项国家级项目; 2、受邀作为国家自然科学基金面上项目、青年项目、地区项目的项目评审人; 3、带领博士研究生、硕士研究生等在 Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics等国际高水平SCI期刊发表论文三十余篇等; 4、特邀为Nature Communications、Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics、 Advanced Sciences、 Genome Biology、 Clinical and Translational Medicine等国际高水平SCI期刊的审稿人

Fudan University

博后-生物信息学

Fudan University

LinkedIn
2014-7 - 2016-10 · 2 yrs 4 mos

1、博后期间发表高水平SCI论文多篇; 2、博后出站时评为优秀等

Karolinska Institutet

博后-生物信息学

Karolinska Institutet

LinkedIn
2015-3 - 2016-5 · 1 yr 3 mos

瑞典

1、以第一作者或共一在Nature Communications、 Genome Research等国际顶尖SCI期刊发表单细胞测序相关论文; 2、在瑞典、荷兰等参加多次国际单细胞测序相关会议; 3、在瑞典用英语分享本人的单细胞测序相关数据分析研究成果多次等

Education

East China Normal University

East China Normal University

LinkedIn

生物信息学

2009 - 2014 · 5 yrs
Wuhan University

Wuhan University

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生物科学(本科双学位)

2007 - 2009 · 2 yrs
Huazhong Agricultural University

Huazhong Agricultural University

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计算机科学与技术

2005 - 2009 · 4 yrs

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